วัดมธุรสติยาราม มีพระอุโบสถเจดีย์และวิหารที่ตั้งอยู่ภายในบริเวณกำแพงแก้วเดียวกัน โดยวางจัดกลุ่มได้เหมาะสม มีรูปทรงที่งดงาม เป็นเอกลักษณ์ของสถาปัตยกรรมสมัยอยุธยาตอนปลายชัดเจน พระอุโบสถลักษณะอาคารเป็นรูปโค้งสำเภาก่ออิฐถือปูน กว้าง 4 เมตร ยาว 8 เมตร